In seiner Funktion als Geschäftsführer der Internationalen Bodensee-Hochschule koordiniert Markus Rhomberg seit 2017 die Zusammenarbeit von 27 Universitäten und Hochschulen in der Vierländerregion Bodensee in Forschung, Lehre, Innovation und Wissens- und Technologietransfer. Zuvor war er Professor und Lehrstuhlinhaber unter anderem an der Universität Hamburg und der Zeppelin Universität Friedrichshafen. In einer Vielzahl von Drittmittelprojekten und Publikationen arbeitete er zu Fragen von öffentlichen Debatten in Politik und Wissenschaft und zur konkreten Ausgestaltung von Science-Policy-Interfaces.